Harm steht unter dem Verdacht, Lt. Singer ermordet zu haben. Doch auch nach seiner Verhaftung gehen die Ermittlungen weiter. Special Agent Gibbs hat Zweifel an seiner Schuld und das Gefühl, dass ihm der Mord angehängt werden soll. Es stellt sich heraus, dass die ihn belastenden Indizien erst zu einem späteren Zeitpunkt platziert wurden. Offensichtlich versucht jemand ganz gezielt, den Verdacht auf Harm zu lenken. Gibbs beauftragt Special Agent DiNozzo weiter nach Beweisen zu suchen, während er selbst von NCIS Director Morrow zu einem Kreuzer im Mittelmeer geschickt wird, um einen Terrorverdächtigen zu verhören.