Ancora un incendio. Questa volta divampa a bordo di una nave della marina. Nel corso dell'indagine la squadra dell'NCIS acquisisce importantissime prove di un pericolo che potrebbe mettere a rischio l'intera Marina degli Stati Uniti. Intanto Tony DiNozzo e Ziva sono diretti in Italia a bordo di una nave della marina quando su di essa viene scoperta una bomba nascosta. Alla fine l'incendiario viene catturato e confessa il nome del mandante: Harper Dearing, un grosso industriale. Alla fine dell'episodio Gibbs appende la foto del ricercato alla parete dei criminali dell'NCIS, più precisamente sopra quella di Osama Bin Laden, e mobilita tutti gli agenti dell'NCIS per catturarlo.