“下一个满月的夜晚 在月影岛上将会再次开始有影子消失 请你调查原因 麻生圭二”——柯南、小兰、小五郎被神秘的委托人叫到伊豆的小岛——月影岛。在村公所询问关于委托人——麻生圭二的事情时,得知他是12年前杀害了妻子和女儿,自己也在家里纵火弹奏钢琴奏鸣曲《月光》而死亡的有名的钢琴家。本以为是恶作剧,但委托费已经送来了。柯南他们决定再调查一下麻生圭二。在途中顺便去了月影岛诊疗所,向医生浅井成实请教了村子的情况。 村里现在正在进行村长选举。渔民代表清水正人,最近评价不太好的现任村长黑岩辰次,还有村里最大的资本家川岛英夫三人参加了竞选。而且今天是前村长龟山的第三年忌辰。在公民馆,除了这三个人以外,还有很多人为了准备而集合在一起,所以成实建议去听他们的谈话。 在公民馆等待的时间,柯南决定到里面看看。而里面的房间里放着钢琴。寻找柯南而来的小兰和小五郎也一起看着钢琴,这时黑岩村长的秘书平田和明慌慌张张地走了过来。据平田说,钢琴是麻生圭二12年前去世前在演奏会上演奏的钢琴,龟山村长也因此而死亡。而在龟山村长去世之前,则弹奏着《月光》…… 法事一开始,村长选举候选人们、成实医生、黑岩村长的女儿黑岩令子、女婿村泽周一等也现身了。在三周年忌日的法事被推进之时,《月光》骤然响起……