Shido Itsuka lebt mit seiner kleinen Schwester Kotori ein unbeschwertes Leben. Als sich während des Schulunterrichts plötzlich ein Erdbeben ereignet, begegnet Shido zum ersten Mal einem kleinen Geistermädchen, das er Tohka tauft. Schafft es Shido, ihre Kräfte zu versiegeln und damit die gefährlichen Beben zu stoppen?