스에무라 살해 현장에 설치된 폭탄에서 요네쿠라, 온다, 스에무라의 전 동료 이시자와의 지문이 발견된다. 경감 오타키와 아야노코지는 그를 용의자로 보고 집으로 향한다. 그를 용의자로 믿고 집으로 향하지만, 두 손이 묶인 채 뒤통수에서 피를 흘리고 있는 그를 발견합니다. 한편 케이지는 온다를 조사하기 위해 교토로 가고, 코난은 요네쿠라, 온다, 스에무라의 관계를 조사해온 하이바라를 만난다. 15년 전, 세 사람 모두 빚을 지고 있었고, 세 사람 모두 10년 전에 빚을 갚았다...